¿Virus en pendrive?

Ahora tengo un problema con el pendrive
Lo pongo y el sistema antivirus me detecta uno en archivo vendet o algo parecido. Borro todo el conteniodo del pendrive, lo formateo y se va todo menos, una papelera de reciclaje y un archivo con el nombre "run"
Formateo, y continua ahi, tanto esa papelera de reciclaje como el maldito archivo.
¿Qué puedo hacer?

He mirado un poco por la red y he encontrado esto: "Para hacer un formateo correcto tendríamos que formatearlas en sistema de archivos FAT (OJO, NO en FAT32, y mucho menos en NTFS)"
En fin que eso es lo que he hecho y parece que ha funcionado.