problema con el disco duro

No se si debido a un virus o a q, pero el caso es q tngo una carpeta q no la puedo borrar, me dice error del sistema de archivos 1026. Esta carpeta tiene dentro 2 carpetas, a una le he puesto h y a la otra i. Pues dentro de la h hay carpetas y archivos con nombres tipo codigos con muy mala pinta. Pero el problema mayor, esq la carpeta i vuelve a tener las 2 carpetas h e i, así sucesivamente hasta el infinito o hasta dnd sea. Si le doy a propiedades de la carpeta me pone 1.5 terabytes o así, cosa imposible, pero bueno.
He intentado borrarlo desde dos y no se puede, tampoco puedo pasar el scandisk pq dice q una aplicación de unidad de disco desconocida está usando el disco duro. Pero he mirado en autoexec, config, y en los programas q se cargan al inicio y no hay nada raro.
Alguna solución, aparte del formateo?
Gracias