Alwar: los hilos negros que salen de la Fuente de Alimentación son todos masa o 0 Voltios, que es lo mismo. Ten en cuenta que la fuente proporciona una salida más negativa que el 0, de -12 V.

Aguilaroja: en los molex, efectivamente, el amarillo es +12 V, el rojo +5 V y los dos negros el punto común, masa, 0V o la referencia. Como se quiera.

Saludos.