Si te refieres a la eheim 1048 / 1046 / 1250 y las compact, son a 220v, es decir tendras q ingeniartelas para sacar el enchufe fuera de la caja y conectarlo a una regleta o algo.
Podrias fabricarte un circuito con un relé para que se active al arrancar el pc. Hay guias por las paginas de modding.
Podrias tambien hacer un interruptor en el frontal.

En eso juega la imaginacion.

Hay una eheim que va a 12v y te ahorras ese engorro.