Como b-man dice la mejor manera de medir es under core, es decir bajo el micro. Para ello se deben cumplir una serie de requisitos con respecto a la sonda y es que sea lo suficientemente fina como para poder pasarla entre los pines del micro y poder cerrar el socket.
Las del DD5+ (como el que tengo yo) no cumplen estos requisitos, son demasiado anchas para poder cerrar el micro después de haberla pasado por entre los pines, así que quedan pocas opciones.

En esta misma web Franzol publicó una guía que hice sobre el ensamblaje de mi PC ORTHANC, donde explico en detalle y con fotos la colocación de las sondas y las diferentes formas de tomar la temperatura, te paso el link:

http://www.hard-h2o.com/public/hardh.../030915orthanc

Un saludo,,