Es un caso raro,pues deberia ir a mejor las temperaturas con esa nueva caja,y dices que lleva 2 ventiladores de entrada ¿de que medida son? y 2 mas me imagino que iguales que los de entrada sacando el aire ,mas el de la fuente de alimentacion,si fuera asi estarias ,en teoria intentando sacar mas aire del que entra en la caja,ese podria ser un problema.