Lo que yo hice cuando pase de mi antigua y querida 8800Gt a mi actual 5850 fue lo siguiente:
1) Descargue los drivers actualizados de mi nueva grafica, pero no los instale.
2) Desinstale todos los drivers de Nvidia desde el panel de control.
3) Reinicie en modo seguro y pase el Driver Sweeper para eliminar todo rastro de los drivers de Nvidia.
4) Abri la caja y realice el cambio de graficas ( esto es obvio).
5) Volvi a iniciar normalmente e instale los nuevos drivers de ATI.

Creo que con eso deberia bastar para que tu equipo vuelva funcionar normalmente.
Y para evitar problemas, yo peronalmente desinstalaria todo lo referente a ATi y lo volveria instalar de nuevo una vez hecha la limpieza.

PD: Asegurate de no borrar algunas carpetas de juegos que tengas instalados y que contienen la informacion del Physx, solo la relativa a la grafica.